更新时间:2024-10-28 16:22:45
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内参蛋白一般是指由管家基因编码表达的蛋白,这些蛋白在各组织和细胞中的表达量相对恒定。
内参蛋白的作用主要是用来校正蛋白样品定量和上样过程中的误差,提高实验结果的准确性,同时作为WB实验的对照。
内参蛋白的选择
①根据实验样本的物种来源进行选择,对于哺乳动物的样本,通常选择GAPDH、β-actin、β-tubulin、Lamin B、Histone H3,植物样本常用actin、Rubisco。
②如果检测亚细胞定位的蛋白时,可选择对应细胞器定位的内参蛋白,更能体现内部参照的准确性。
③内参蛋白一般需要与目标蛋白分子量相差5KD以上
内参蛋白选择注意事项:
糖代谢和缺氧模型中会增加GAPDH在特定细胞和组织中的表达,因此不能用GAPDH做内参;细胞骨架相关研究、骨骼肌样本不能用β-actin做内参,在脂肪组织和细胞中β-actin表达量较少;细胞毒性实验时不能用Lamin B做内参。
Histone H3在细胞核中表达相当稳定,缺氧模型一般可以用Tublin。在做多组织多细胞样本对比表达量时,最好选择GAPDH作为内参,GAPDH属于代谢类蛋白,在活组织中表达比较恒定。检测磷酸化蛋白或诱导后样本时,通常选择结构蛋白如β-actin或β-Tubulin。
内参蛋白参考表
上样对照  | 分子量(kDa)  | 蛋白定位  | 
42  | 全细胞  | |
37  | ||
β-tubulin  | 55  | |
α-tubulin  | 52  | |
Vinculin  | 123  | |
α-Actinin  | 103  | |
Cyclophilin B  | 21  | |
上样对照  | 分子量(kDa)  | 蛋白定位  | 
Histone H3  | 15  | 细胞核  | 
HDAC1  | 65  | |
Lamin B1  | 68  | |
PCNA  | 33  | |
上样对照  | 分子量(kDa)  | 蛋白定位  | 
COX IV  | 17  | 线粒体  | 
VDAC1  | 31  | |
ATP5A  | 60  | |
Tom20  | 17  | |
上样对照  | 分子量(kDa)  | 蛋白定位  | 
Na+/K+-ATPase α1  | 100  | 胞膜  | 
上样对照  | 分子量(kDa)  | 蛋白定位  | 
Calnexin  | 90  | 内质网  | 
ERp57  | 55  | |
Calregulin  | 48  | |
Endoplasmin  | 92  | |
上样对照  | 分子量(kDa)  | 蛋白定位  | 
GRASP55  | 47  | 高尔基体  | 
GM130  | 130  | |
上样对照  | 分子量(kDa)  | 蛋白定位  | 
CD9  | 25  | 外泌体(Exosome)  | 
CD81  | 26  | |
CD63  | 25  | |
上样对照  | 分子量(kDa)  | 蛋白定位  | 
ATG12  | 15  | 自噬小体(Autophagosomes)  | 
LC3B  | 14、16  | |
上样对照  | 分子量(kDa)  | 蛋白定位  | 
CENPJ  | 147  | 中心体(Centriole)  | 
上样对照  | 分子量(kDa)  | 蛋白定位  | 
RAB11B  | 28  | 内含体(Endosome)  | 
EEA1  | 162  | |
上样对照  | 分子量(kDa)  | 蛋白定位  | 
Ribosomal Protein S3  | 30  | 核糖体(Ribosome)  | 
Ribosomal Protein S6  | 28  | |
上样对照  | 分子量(kDa)  | 蛋白定位  | 
Catalase  | 60  | 过氧化物酶体(Peroxisome)  | 
上样对照  | 分子量(kDa)  | 蛋白定位  | 
LAMP1  | 120  | 溶酶体(Lysosome)  | 
LAMP2  | 100  | |
上样对照  | 分子量(kDa)  | 蛋白定位  | 
BMI1  | 37  | 细胞小体(CellularBoies)  |