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内参蛋白

更新时间:2024-10-28 14:50:18

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内参蛋白一般是指由管家基因编码表达的蛋白,这些蛋白在各组织和细胞中的表达量相对恒定。

内参蛋白的作用主要是用来校正蛋白样品定量和上样过程中的误差,提高实验结果的准确性,同时作为WB实验的对照。

内参蛋白的选择

①根据实验样本的物种来源进行选择,对于哺乳动物的样本,通常选择GAPDH、β-actin、β-tubulin、Lamin B、Histone H3,植物样本常用actin、Rubisco。

②如果检测亚细胞定位的蛋白时,可选择对应细胞器定位的内参蛋白,更能体现内部参照的准确性。

③内参蛋白一般需要与目标蛋白分子量相差5KD以上

内参蛋白选择注意事项:

糖代谢和缺氧模型中会增加GAPDH在特定细胞和组织中的表达,因此不能用GAPDH做内参;细胞骨架相关研究、骨骼肌样本不能用β-actin做内参,在脂肪组织和细胞中β-actin表达量较少;细胞毒性实验时不能用Lamin B做内参。

Histone H3在细胞核中表达相当稳定,缺氧模型一般可以用Tublin。在做多组织多细胞样本对比表达量时,最好选择GAPDH作为内参,GAPDH属于代谢类蛋白,在活组织中表达比较恒定。检测磷酸化蛋白或诱导后样本时,通常选择结构蛋白如β-actin或β-Tubulin。

内参蛋白参考表

上样对照

分子量(kDa

蛋白定位

β-actin

42

全细胞

GAPDH

37

β-tubulin

55

α-tubulin

52

Vinculin

123

α-Actinin

103

Cyclophilin B

21

上样对照

分子量(kDa

蛋白定位

Histone H3

15

细胞核

HDAC1

65

Lamin B1

68

PCNA

33

上样对照

分子量(kDa

蛋白定位

COX IV

17

线粒体

VDAC1

31

ATP5A

60

Tom20

17

上样对照

分子量(kDa

蛋白定位

Na+/K+-ATPase α1

100

胞膜

上样对照

分子量(kDa

蛋白定位

Calnexin

90

内质网

ERp57

55

Calregulin

48

Endoplasmin

92

上样对照

分子量(kDa

蛋白定位

GRASP55

47

高尔基体

GM130

130

上样对照

分子量(kDa

蛋白定位

CD9

25

外泌体(Exosome

CD81

26

CD63

25

上样对照

分子量(kDa

蛋白定位

ATG12

15

自噬小体(Autophagosomes

LC3B

1416

上样对照

分子量(kDa

蛋白定位

CENPJ

147

中心体(Centriole

上样对照

分子量(kDa

蛋白定位

RAB11B

28

内含体(Endosome

EEA1

162

上样对照

分子量(kDa

蛋白定位

Ribosomal Protein S3

30

核糖体(Ribosome

Ribosomal Protein S6

28

上样对照

分子量(kDa

蛋白定位

Catalase

60

过氧化物酶体(Peroxisome

上样对照

分子量(kDa

蛋白定位

LAMP1

120

溶酶体(Lysosome

LAMP2

100

上样对照

分子量(kDa

蛋白定位

BMI1

37

细胞小体(CellularBoies